Досвід їх створення був використаний у роки Великої Вітчизняної війни. Початок формування штрафних батальйонів та рот та загороджувальних загонів поклав наказ № 227 наркома оборони (НКО) СРСР І. В. Сталіна від 28 липня 1942 м.
25 липня 1942 року була сформована найперша штрафна рота Великої Вітчизняної війни – Окрема штрафна рота 42-й армії Ленінградського фронту, у складі 42-й армії вона воювала до 10 жовтня 1942 року і була розформована.
Загалом у період Великої Вітчизняної було сформовано 65 штрафних батальйонів та 1037 штрафних рот. Таке число пояснювалося тим, що багато хто з них існував короткий час.
У книзі штрафники, що засіли на болоті, доводять німців до непритомного жаху нічними вигуками «Гу-га!», а потім із цими ж вигуками йдуть у атаку. «Утретє і вчетверте починаємо ми: — Гу-га, гу-га, гу-га!